Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC33Q8N5R6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC33Q8N5R6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms