Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAG2Q8N3U4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms