Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHTF2Q8N3S3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms