Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VPS8Q8N3P4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS8Q8N3P4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
VPS8Q8N3P4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
VPS8Q8N3P4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
VPS8Q8N3P4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
VPS8Q8N3P4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms