Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CA13Q8N1Q1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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CA13Q8N1Q1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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CA13Q8N1Q1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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CA13Q8N1Q1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CA13Q8N1Q1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA13Q8N1Q1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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