Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC47Q8N1G4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC47Q8N1G4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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