Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms