Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE3Q8IX30 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms