Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR49Q8IV35 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms