Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC84Q86UT8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC84Q86UT8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms