Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRGAP1Q7Z6B7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP1Q7Z6B7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms