Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT27Q7Z3Y8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms