Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS2ST1Q7LGA3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms