Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2BQ7L1I2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms