Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms