Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms