Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms