Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMFQ6X4W1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms