Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms