Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC174Q6PII3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms