Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCE2Q6PIF2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms