Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTR9Q6PD62 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms