Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNP1Q6NT89 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms