Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD7BQ6GQQ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD7BQ6GQQ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms