Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCTP1Q6DN14 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms