Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL3Q6DD88 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms