Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARA3Q6AZY7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms