Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF43Q68DV7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF43Q68DV7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms