Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms