Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHIC1Q5VXU3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHIC1Q5VXU3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms