Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPATA1Q5VX52 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms