Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms