Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf60Q5U649 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf60Q5U649 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms