Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN9Q5TKA1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN9Q5TKA1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms