Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOGA3Q5TF21 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms