Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT6Q5T7P8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT6Q5T7P8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms