Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms