Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms