Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms