Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CD-AS1Q5SR53 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CD-AS1Q5SR53 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CD-AS1Q5SR53 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms