Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN4Q5MJ08 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms