Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC158Q5M9N0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC158Q5M9N0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms