Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms