Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIN3Q5JUX0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms