Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNT1Q5JUK3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms