Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC4Q5GLZ8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms