Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR3Q5GH77 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms