Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL12Q53G59 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms