Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms