Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFTN2Q52LD8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms